این دو ژن باعث ایجاد رنگ‌های اصلی چشم (قهوه‌ای، سبز و آبی) می‌شوند. با این حال، ژن سوم که هنوز شناسایی نشده است، در ترکیب با دو ژن دیگر، رنگ‌های میانی (مانند خاکستری و فندقی) را ایجاد می‌کند.

تحقیقات در مورد رنگ چشم حقایق قانع‌کننده دیگری را آشکار کرده است که برخی از آنها در زیر ارائه شده است:

• ژن‌هایی که کودک از هر دو والدین به ارث می‌برد، دلیل رنگ مشکی، قهوه‌ای، آبی، خاکستری، سبز، فندقی یا ترکیبی از این رنگ‌ها در چشم‌های اوست.
• اینکه چگونه ژن‌ها با هم ترکیب می‌شوند تا رنگ چشم انسان را ایجاد کنند، قبل از تولد قابل پیش‌بینی نیست.
• اگر والدین چشمان قهوه‌ای داشته باشند، احتمال بیشتری وجود دارد که فرزندشان چشمان قهوه‌ای داشته باشد، اگرچه رنگ چشم کودک ممکن است کاملاً با رنگ چشم والدینش متفاوت باشد.
• جالب‌تر اینکه، گاهی اوقات، کودکان با دو چشم با رنگ‌های متفاوت متولد می‌شوند. این وضعیت به عنوان هتروکرومی شناخته می‌شود و دلایل مختلفی باعث آن می‌شود.